1985
Berdasar Surat Keputusan Pimpinan Wilayah Muhammadiyah Jawa Timur No. : Kep/003-V/1985, Fakultas Da’wah (FIAD), Fakultas Tarbiyah dan Fakultas Syari’ah berinduk ke UMSurabaya, dan ketiganya tergabung dalam Fakultas Agama Islam (FAI).
1992
Pimpinan Pusat Muhammadiyah Majelis Pembina Kesehatan melalui Surat No.:IV.B/4.a/220/1992 tanggal 14 Desember 1992 mengajukan Permohonan Pendirian Pendidikan Ahli Madya Kesehatan di lingkungan Muhammadiyah/Aisyiyah kepada Sekretaris Jenderal Departemen Kesehatan RI. UMSurabaya termasuk salah satu yang diminta untuk membuka program pendidikan dimaksud.
1993
Berdasar SK Menteri Kesehatan RI No.: Hk.00.06.1.1.3331 tanggal 8 September 1993 secara resmi berdiri AKADEMI KEPERAWATAN (AKPER) di lingkungan UMSurabaya
2000
Tanggal 1 Januari 2000 berdiri Fakultas Hukum
2001
Berdiri pula Akademi Analis Kesehatan (AAK) dengan SK Dikti No. 184/D/O/2001 tanggal 26-09-2001.
2004
Universitas Muhammadiyah Surabaya berupaya mendirikan program pascasarjana (magister Studi Islam), dan berdasarkan SK Dj.II/363/2004 telah berdiri Program Studi Magister Pendidikan Islam dari Kementerian Agama
2005
Universitas Muhammadiyah Surabaya mendapatkan rekomendasi dari Badan Pengembangan dan Pemberdayaan Sumber Daya Manusia (BPPSDM) Departemen Kesehatan RI No. H.K.0312.4.1.03259 untuk pendirian Program Studi Ilmu Keperawatan dan berdasarkan hasil visitasi Pengurus Pusat Persatuan Perawat Nasional Indonesia (PPNI) Nomor 553/PP.PPNI/K/X/2005 tanggal 5 Oktober 2005, serta berdasarkan Keputusan Dirjen Dikti No.277/D/T2006 tanggal 30 Januari 2006 UM Surabaya telah diberikan izin untuk menyelenggrarakan Program Studi IImu Keperawatan (SI) Fakultas Ilmu Kesehatan.
2006
Berdasarkan Keputusan Dirjen Dikti No. 006/D/T/2006 UM Surabaya diberikan izin untuk menyelenggarakan Program Studi D3 Kebidanan. Berdasarkan terbitnya izin Prodi tersebut, tahun 2006 program studi di bidang kesehatan antara lain Program Studi D-3 Keperawatan, Akademi Analis Kesehatan, Program Studi Ilmu Keseperawatan dan Program Studi D-3 Kebidanan menjadi satu fakultas dengan nama Fakultas Ilmu Kesehatan (FIK).
2008
Universitas Muhammadiyah Surabaya dalam mengembangkan pelayanan kesehatan manusia secara komprehensif khusunya dalam menangani masalah psikologis manusia, maka berdasarkan SK Dirjen Dikti No. 2001/D/T/2008 tanggal 25 Juni 2008 telah dibuka program Studi S-I Psikologi
2009
Berdasarkan SK Direktur Jenderal Pendidikan Tinggi No. 1272/D/T/2009 tanggal 31 Juli 2009 berdiri Program Magister Pendidikan Bahasa dan Sastra Indonesia (S-2)
2011
Berdasarkan SK Mendiknas RI Nomor: 164/E/O/2011 tanggal 4 Agustus, Universitas Muhammadiyah Surabaya, menambah program profesi, yang merupakan bagian terintegrasi dari program studi ilmu keperawatan (S-1)
2012
Berdasarkan SK Direktur jenderal Pendidikan Tinggi No. 48/E/O/2012 tanggal 8 Pebruari 2012 telah berdiri Program Studi Pedidikan Guru Pendidikan Anak Usia Dini (PG PAUD)
2014
Berdiri Program Studi Perbankan Syariah dengan SK Dirjen Pend. Islam Kemenag RI Nomor 3656 Tahun 2014 tanggal 1 Juli 2015.
2015
Universitas Muhammadiyah Surabaya menambah 3 program studi, diantaranya S-1 Pendidikan Guru Sekolah Dasat dengan SK Menristekdikti RI Nomor 25/KPT/I/2015 tanggal 15 September 2015, S-2 Hukum EKonomi Syariah dengan SK Dirjen Pendidikan Islam Nomor: 3243 Tahun 2015 tanggal 8 Juni 2015, dan S-1 PGMI dengan SK SK Dirjen Pend. Islam Kemenag RI Nomor 6063 Tahun 2015 tanggal 23 Oktober 2015, namun dalam perjalananya khusus untuk PGMI tidak ada proses penerimaan mahasiswa baru
2016
Dalam rangka pengembangan program studi dalam bidang kesehatan, maka Universitas Muhammadiyah Surabaya, diberi ijin untuk mendirikan program studi Pendidikan dokter dan profesi dokter, dengan SK SK Menristekdikti RI Nomor 124/KPT/I/2016 tanggal 23 Maret 2016
2018
Universitas Muhammadiyah Surabaya menambah 2 program studi, diantaranya S1 Kebidanan dan Profesi Bidang dengan SK SK Menristekdikti Nomor 896/KPT/I/2018 tanggal 16 Oktober 2018, dan Program Studi Teknik Industri dengan SK Menristekdikti RI Nomor 981/KPT/I/2018 tanggal 8 Nopember 2018
2019
Universitas Muhammadiyah Surabaya diber Ijin Pembukaan program Studi S-1 Farmasi. SK Menristekdikti RI Nomor 730/KPT/I/2019 tanggal 19 Agustus 2019. Dalam Perkembanganya sampai dengan bulan September 2019, Program Studi di Universitas Muhammadiyah Surabaya telah terakreditasi oleh BAN-PT dan LAM-PT Kes.